Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNPPD1Q9BV87 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms