Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD5Q99666 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD5Q99666 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms