Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms