Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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