Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms