Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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