Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH1Q15438 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms