Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms