Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CHAF1BQ13112 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms