Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms