Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms