Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KB1P23443 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms