Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms