Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC144AA2RUR9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms