Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK2Q9UPX8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms