Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN11AQ9UI33 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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