Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHORDC1Q9UHD1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms