Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms