Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms