Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HELQQ8TDG4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HELQQ8TDG4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms