Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR53Q7Z5U6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms