Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM5Q71RC9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms