Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms