Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCA8Q53HL2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms