Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms