Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SPIDRQ14159 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPIDRQ14159 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPIDRQ14159 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPIDRQ14159 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPIDRQ14159 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPIDRQ14159 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPIDRQ14159 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPIDRQ14159 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPIDRQ14159 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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