Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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