Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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RPA4Q13156 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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RPA4Q13156 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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RPA4Q13156 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPA4Q13156 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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