Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TROQ12816 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TROQ12816 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TROQ12816 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TROQ12816 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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