Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms