Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms