Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms