Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA11P31270 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms