Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP1P30622 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms