Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-EP13747 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms