Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTA1P02549 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTA1P02549 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms