Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD2O96028 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms