Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC7A4O43246 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms