Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms