Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC9Q9Y3B6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms