Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FBXL4Q9UKA2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms