Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms