Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms