Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRDM12Q9H4Q4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms