Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms