Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAF2Q96CS3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms