Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AVL9Q8NBF6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms