Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms