Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms