Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SPHKAPQ2M3C7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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